Díky vysoké teplotě ve whirlpoolech a díky nepravidelnému provozu cirkulace se v cirkulačním okruhu usazuje šlem tvořený biologickými nečistotami. Tato hmota je velmi úrodnou půdou pro různé druhy bakterií, včetně kolonizující legionely a pseudomonády. Přípravky péče o whirlpool nejsou pro odstranění tohoto šlemu dostačující a proto je nezbytně nutné pravidelně před vypuštěním vany důkladně vyčistit cirkulační okruh vířivky. Orientační použití – veřejný provoz – jednou za 1 – 2 týdny, soukromý provoz – před každým vypuštěním, minimálně jednou za 4 měsíce!